Analyse des signatures génomiques et transcriptomiques des tumeurs pulmonaires pour des applications en médecine personnalisée.
No Thumbnail Available
Date
2025-06-18
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
UNIVERSITE ABBES LAGHROUR - KHENCHELA
Abstract
Nous avons exploré l’expression de 24 gènes impliqués dans le cancer, l’asthme et la maladie
d’Alzheimer chez 1000 patients. Une analyse en composantes principales a révélé une forte
corrélation entre les gènes EGFR et MET (r = 0,899), suggérant une co-régulation connue dans
le cancer du poumon. À l’inverse, GATA3 et GSTP1, deux gènes liés à l’asthme, présentaient
une corrélation négative modérée, traduisant possiblement des mécanismes opposés. Le biplot de
l’ACP a mis en évidence deux axes majeurs : l’un distinguant des profils immunitaires (GATA3
vs HLA-DRB1), l’autre opposant un profil oncogénique à un profil neuro-inflammatoire.
L’analyse différentielle a mis en évidence plusieurs gènes significativement modifiés selon le
statut tabagique. Parmi eux, HLA-DRB1 était sur-exprimé, tandis que GATA3 et MAPT étaient
sous-exprimés chez les fumeurs. L’enrichissement fonctionnel a révélé une implication
significative des gènes dans la voie PI3K, ainsi que dans des fonctions de liaison protéique, de
transduction de signal et de liaison ionique, soutenant leur rôle central dans la régulation
cellulaire. Ces résultats éclairent les interactions géniques dans des contextes pathologiques
complexes et soutiennent le potentiel de certaines cibles moléculaires en médecine
personnalisée.
قمنا بدراسة التعبير الجيني لـ 24جينًا مرتبطًا بالسرطان، والربو، ومرض ألزهايمر لدى عيّنة مك ّونة من 1000مريض .وقد كشفت
تحليلات المك ّونات الرئيسية ) (ACPعن وجود ارتباط قوي بين الجينين EGFRو) ،MET (r = 0,899م ّما يشير إلى تنظيم مشترك معروف
في سرطان الرئة .في المقابل، أظهر الجينان GATA3و ،GSTP1المرتبطان بالربو، ارتباطًا سالبًا معتد ًلً، ما قد يعكس آليات مرضية
متعارضة .وقد أبرز تمثيل الـ biplotلتحليل ACPمحورين رئيسيين :الأول يميّز بين الأنماط المناعية( مثل GATA3مقابل-HLA
) ،DRB1والثاني يف ّرق بين نمط ورمي ) (oncogéniqueونمط التهابي عصبي ). (neuro-inflammatoireكما كشفت التحاليل
التفاضلية عن تغيرات معنوية في تعبير بعض الجينات حسب حالة التدخين؛ حيث كان الجين HLA-DRB1مفرط التعبير لدى المدخنين،
بينما انخفض تعبير GATA3و MAPTفي نفس الفئة .وأظهرت تحاليل الإثراء الوظيفي انخراط هذه الجينات في مسار PI3Kالحيوي،
بالإضافة إلى وظائف متعلّقة بارتباط البروتينات، ونقل الإشارة، والًرتباط بالأيونات، مما يع ّزز دورها المحوري في التنظيم الخلوي .تسلّط
هذه النتائج الضوء على التفاعلات الجينية في سياقات مرضية معقّدة وتدعم إمكانيّة استهداف بعض الجزيئات في إطار الطب الشخصي
We explored the expression of 24 genes involved in cancer, asthma and Alzheimer’s disease in 1000
patients. A Principal Component Analysis revealed a strong correlation between EGFR and MET
genes (r = 0.899), suggesting known co-regulation in lung cancer. Conversely, GATA3 and GSTP1,
two asthma-related genes, showed a moderate negative correlation, possibly reflecting opposite
mechanisms. The biplot of PCA highlighted two major axes: one distinguishing immune profiles
(GATA3 vs HLA-DRB1), the other opposing an oncogenic profile to a neuroinflammatory profile.
The differential analysis highlighted several genes significantly modified according to smoking status.
Among them, HLA-DRB1 was overexpressed, while GATA3 and MAPT were underexpressed in
smokers. Functional enrichment revealed significant involvement of genes in the PI3K pathway, as
well as protein binding, signal transduction and ion binding functions, supporting their central role in
cell regulation. These results shed light on gene interactions in complex pathological contexts and
support the potential of certain molecular targets in personalized medicine.