Synthèse, caractérisation et étude théorique des dérivés ferrocéniques à l’aide de la théorie de la fonctionnelle de la densité DFT et leurs effets d’interactions avec l’ADN
No Thumbnail Available
Date
2024-07-03
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Grâce à l'utilisation de la voltammétrie cyclique, l'interaction entre divers dérivés du ferrocène
et l'acide désoxyribonucléique (ADN) double brin a été examinée en profondeur dans une
solution. Pour valider les résultats de la voltammétrie cyclique, la spectroscopie électronique a
été réalisée dans des conditions identiques. En analysant le changement de potentiel de pic
anodique et la réduction du courant de pic anodique, des informations cruciales concernant le
mode d'interaction, des adduits (dérivés ferrocéniques-ADN) ont été déterminées. De plus, la
spectroscopie électronique a été utilisée pour calculer les constantes de liaison et l’énergie libre
de liaison, donnant des résultats qui correspondent à ceux obtenus par voltammétrie cyclique.
Pour examiner plus en détail l'interaction, l'amarrage moléculaire a été réalisé à l'aide du logiciel
AutoDock 4.2.6. Avant l'amarrage, les structures des dérivés ferrocènes ont été optimisées à
l'aide du logiciel Gaussian 09 et enregistrées au format PDB. Pour répondre aux exigences du
logiciel AutoDock, les ligands ont été convertis au format PDBQT à l'aide du logiciel
OpenBabel 2.3.0.
Les paramètres d'interaction dérivés de l'amarrage moléculaire s'alignent étroitement sur les
résultats expérimentaux. En appliquant l'équation de Randles-Sevcik, les coefficients de
diffusion des formes non liées et liées à l'ADN ont été déterminés. Fait intéressant, le calcul a
révélé que les coefficients de diffusion des adduits sont inférieurs à ceux des composés non liés.
De plus, les données électrochimiques ont montré que tous les dérivés du ferrocène étudiés sont
situés dans le petit sillon de l'ADN. Le potentiel de pic anodique présentait un décalage négatif
et la taille du site de liaison pour les adduits dérivés de ferrocène-ADN s'est avérée relativement
petite. Ces observations suggèrent fortement la présence d'une interaction électrostatique entre
les dérivés du ferrocène et l'ADN.