Isolement de souches actinomycetales à partir de sols rhizosphériques et de sebkha : mise enévidence de l'activité antimicrobienne
No Thumbnail Available
Date
2015-06
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Université Abbes Laghrour -Khenchela-
Abstract
Résumé:
Isolement de souches actinomycètales à partir de sols rhizospheriques et de sebkha:
mise en évidence de l’activité antimicrobienne.
Un total de 99 isolats se rapprochant par leurs aspects macroscopiques des
Actinomycètes a été isolé à partir de 3 échantillons de sols de différentes régions, dont deux
échantillons ont été prélevé à partir de la wilaya de Khenchela à partir du sol forestier
rhizospherique d’Al Hamma et de sol montagneux de l’Aurès, la troisième échantillon a été
prélevé à partir de la Sebkha de Gureat Guellif situé dans la wilaya d’Oum El Bouaghie, en
utilisant la méthode d’isolement suspension-dilution. Parmi ces isolats, 65 ont été isolés à
partir de sol forestier rhizosphérique, 23 ont été isolées à partir de la Sebkha et 11 ont été
prélevées à partir du sol montagneux. Dans le but de découvrir de nouvelles molécules
antibiotiques, l’activité antimicrobienne des 65 isolats du sol forestier rhizospherique et les 23
isolats de la Sebkha a été mise en évidence envers quatre bactéries à Gram positif (Bacillus
subtilis, Staphylococcus ATTCC 25923, Staphylococcus MRSA 43300 et Enterococcus fecalis)
et quatre bactéries à Gram négatif (E.coli, Klebsiella pneumonie, Enterobacter sp et
Acinetobacter sp) et deux champignons pathogènes (Aspergillus niger et Fusarium
oxysporum) par la technique des cylindre d’agar. 41,54% des isolats de sol forestier
rhizospherique et 30,43% des isolats de la sebkha ont montré une activité antibactérienne au
moins vis-à-vis une bactérie test. Ces isolats semblent être plus actifs sur les bactéries à Gram
positif que sur les bactéries à Gram négatif dont E. Coli (0%) a été considéré comme la
bactérie la plus résistante à tous les isolats. En ce qui concerne l’activité antifongique, 17
isolats (26,15%) parmi les 65 isolats du sol forestier rhizospherique ont montré un effet
inhibiteur vis-à-vis au moins un des champignons test, dont l’Aspergillus niger a été plus
sensible (84,21%) aux isolats du sol forestier rhizospherique que Fusarium oxysporum
(62,5%), alors qu’aucune souche isolée à partir de la Sebkha n’a montré un effet antagoniste
vis-à-vis les deux champignons test. Il apparait donc nécessaire de s’orienter vers la lutte
contre les bactéries multi-résistante et les champignons pathogènes à l’aide des bactéries
actinomycetales isolées à partir du sol forestier rhizosphérique.
Abstract:
Isolation of actinomycetes strains from rhizosphere soil and sebkha:
evidence of antimicrobial activity.
A total of 99 isolates approaching for their macroscopic aspects to
actinomycetes were isolated from three soil samples from different areas, two samples
were taken from the wilaya of Khenchela from forest rhizosphere soil of Al Hamma and
the Aures mountain soil, the third sample was taken from the Sebkha Gureat Guellif
located in the wilaya of Oum El Bouaghie, using the isolation suspension dilution method.
Among these isolates, 65 were isolated from rhizosphere forest soil, 23 were isolated
from Sebkha and 11 were taken from the mountainous soil. In order to discover new
antibiotic molecules, the antimicrobial activity of 65 isolate of rhizosphere soil forestry
and 23 isolate of Sebkha has been demonstrated against four Gram-positive bacteria
(Bacillus subtilis, Staphylococcus ATCC 25923, Staphylococcus MRSA 43300 and
Enterococcus fecalis) and four Gram-negative bacteria (E. coli, Klebsiella pneumonia,
Enterobacter and Acinetobacter sp) and two pathogenic fungi (Aspergillus niger and
Fusarium oxysporum) by the technique of agar cylinder. 41.54% of forest soil rhizosphere
isolates and 30.43% of isolates sebkha showed antibacterial activity at least against a test
bacteria. These isolates appear to be more active against Gram positive bacteria than
Gram-negative bacteria including E. coli (0%) has been considered as the most resistant
bacteria for all isolates. Regarding the antifungal activity, 17 isolates (26.15%) of the
65 isolates of forest rhizosphere soil showed inhibitory effect against at least one of the
test fungi including Aspergillus Niger was more sensitive (84,21%) than Fusarium
oxysporum (62.5%), while no strain isolated from Sebkha showed an antagonist effect
against both test fungi. It therefore appears necessary to move towards the fight
against multi- resistant bacteria and pathogenic fungi using the Actinomycetales bacteria
isolated from the rhizosphere forest soil.
ملخص :
عزل سلالات الاكتينوميسات من تربات الجذور و السبخة : دراسة الفعالية ضد الميكروبية
تم عزل ما مجموعه 99 سلالة تقترب من الجوانب الظاهرية الى الا كتينوميسات من ثلاث عينات تربة أخذت من ثلاث مناطق مختلفة، حيث تم أخذ عينتين منهما من ولاية خنشلة من تربة غابة الحامة والتربة الجبلية للأوراس أما العينة ثالثة تم أخذها من سبخة قرعة قليف المتواجدة بولاية أم البواقي ، وذلك باستخدام طريقة العزل تخفيف المعلق. من بين هذه السلالات 65 عزلت من تربة الغابة، 23 من السبخة و 11 من التربة الجبلية للأوراس وفي اطار اكتشاف مضادات حيوية جديدة، قد تم اختبار الفعالية ضد ميكروبية للسلالات المعزولة من تربة الغابة و تربة السبخة ضد أربع سلالات بكتيرية موجبة الغرام Bacillus subtilis, Staphylococcus ATTCC 25923, Staphylococcus MRSA 43300 et) Enterococcus fecalis) وأربعة سلالات بكتيرية سالبة الغرام E.Coli, Klebseilla pneumonie (Enterobacter sp, Acinetobacter sp) ونوعين من الفطريات ( Aspergillus niger, Fusarium oxysporum بواسطة تقنية اسطوانات الاغار. قد تبين من خلال هذا الاختبار أن 41,54% من السلالات المعزولة من التربة الغابية و30,43% من السلالات المعزولة من السبخة قد ابدت فعالية ضد ميكروبية على الاقل ضد احد الا نواع البكتيرية المختبرة قد تبين ان هذه السلالات المعزولة قد كانت ذات فعالية كبيرة ضد البكتيرية موجبة الغرام من البكتيرية سالبة الغرام حيث كانت (0) E.coli البكتيرية الاكثر مقاومة لجميع السلالات المعزولة . أما فيما يخص الفعالية ضد الفطرية 17(26,15%) سلالة معزولة من بين 65 المعزولة من التربة الغابية قد بينت فعالية على الاقل ضد احد الفطرين حيث كان (Aspergillus niger) اکثر حساسية (84,21%) للسلالات لهذه السلالات المعزولة من ( Fusarium
يبدو
oxysporum)(%62,5) ، اما السلالات المعزولة من السبخة فإنها لم تبدي اي فعالية ضد كلا الفطرين ولذلك فانة . من الضروري الاتجاه نحو استغلال الاكتينوميسيتات من اجل مكافحة البكتيرية متعددة المقاومة من جهة و محاربة الفطريات الممرضة من جهة اخرى.