Using Pharmacophore modeling and molecular docking to screen and identify potential therapeutic agents for breast cancer
No Thumbnail Available
Date
2024
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
UNIVERSITE ABBES LAGHROUR KHENCHELA
Abstract
Title of the dissertation: Using Pharmacophore modeling and molecular docking to screen
and identify potential therapeutic agents for breast cancer
Full name: khaoula fares
Directed by: RAHAL Khalid and Dr. ZERAIB Azzeddine
Abstract:
Breast cancer is one of the most common causes of death in women and is a major public
health problem worldwide. Pharmacophore modeling and molecular docking, quickly entered
Pharmacophore research.
The aim of this work is to search for ER alpha inhibitors using Pharmacophore modeling
and molecular docking Pharmacophore model ", where a PHB Pharmacophore model was
created based on a structure-based Pharmacophore modeling approach, All potential inhibitors
were examined from six databases with more than 200,000 natural parts and a Pharmacophore
model was created PHA1-PHA2 on a ligand-based Pharmacophore modeling approach in
which compounds with the same chemical properties extracted from 07 confirmed inhibitors of
ER alpha were sought. Using MOE and PHarmit to examine molecular docking online.
The results showed that Pharmacophore modeling PHA1 and PHA2 were more effective
in determining the best docking scores via examined databases, but PHB and despite having
similar properties lacks the appropriate order required to achieve the best activity
Résumé :
Le cancer du sein est l’une des causes les plus fréquentes de décès chez les femmes et constitue
un problème majeur de santé publique dans le monde entier. Modélisation du Pharmacophore et
docking moléculaire, rapidement entré dans la recherche Pharmacophore.
Le but de ce travail est de rechercher des inhibiteurs d’alpha ER en utilisant la modélisation
Pharmacophore et le modèle de docking moléculaire, Nous avons créé un modèle de
Pharmacophore PHB Par une approche de modélisation de Pharmacophore basée sur la structure,
Tous les inhibiteurs potentiels ont été examinés à partir de six bases de données avec plus de
200.000 parties naturelles et un modèle de Pharmacophore PHA1-PHA2 a été créé par une
approche de modélisation de Pharmacophore basée de ligand, dans laquelle des composés avec les
mêmes propriétés chimiques extraits de 07 inhibiteurs confirmés de l’ER alpha ont été recherchés.
nous l'avons utilisé de MOE et PHarmit pour examiner l’ancrage moléculaire en ligne.
Les résultats ont montré que la modélisation de Pharmacophore PHA1 et PHA2 étaient plus
efficaces pour déterminer les meilleurs scores d’ancrage via des bases de données examinées, mais
PHB et malgré avoir des propriétés similaires ne possède pas l’ordre approprié requis pour obtenir
la meilleure activité
الملخص :
عنوان المذكرة : استخدام النمذجة الصيدلانية والالتحام الجزيئي لفحص وتحديد العوامل العلاجية المحتملة لسرطان الثدي
الإسم واللقب : فارس خولة
المؤطر : رحال خالد والدكتور زريب عز الدين .
سرطان الثدي من أكثر أسباب الوفاة عند السيدات وهو مشكلة صحية عامة ورئيسية في جميع أنحاء العالم. حيث دخلت النمذجة الصيدلانية والالتحام الجزيئي بسرعة في مجال البحث الصيدلاني.
الهدف من هذا العمل هو البحث عن مثبطات ER alpha وذلك باستخدام النمذجة الصيدلانية والالتحام الجزيئي، حيث تم انشاء نموذج صيدلاني PHB بناء على منهج النمذجة الصيدلانية القائمة على الهيكل، وتم إجراء فحص لكل المثبطات المحتملة من ستة قواعد للبيانات التي تضم أكثر من 200000 جزئ طبيعي، كما تم انشاء نموذج صيدلاني PHA-PHA2 بناء على منهج النمذجة الصيدلانية القائمة على الربيطة وتم فيها البحث عن مركبات لها نفس الخصائص الكيميائية المستخرجة من 07 مثبطات مؤكدة لER alpha. وذلك باستخدام برنامج MOE و PHarmit لفحص الالتحام الجزيئي عبر الانترنت.
أظهرت النتائج أن النمذجة الصيدلانية PHA1 و PHA2 كانت أكثر فعالية في تحديد أفضل درجات الالتحام عبر قواعد البيانات المفحوصة، أماPHB وعلى الرغم من امتلاكه خصائص مشابهة يفتقر إلى الترتيب المناسب المطلوب لتحقيق أفضل نشاط