Evaluation of antifungal activity of Pistacia atlantica by molecular docking approach
| dc.contributor.author | Medakou Sara | |
| dc.contributor.author | Khiari Amira | |
| dc.contributor.author | Supervisor: Lebaal Salim | |
| dc.date.accessioned | 2024-09-01T12:56:49Z | |
| dc.date.available | 2024-09-01T12:56:49Z | |
| dc.date.issued | 2024 | |
| dc.description.abstract | Abstract: The excessive use of fungicides has caused severe damage to the environment and human health. To mitigate these problems, the use of biopesticides is attracting global attention as a safer strategy compared to traditional chemical pesticides. This is due to their lower risks to humans and the environment. Our work involves studying the antifungal activity of the main compounds of the essential oil of Pistacia atlantica, using a molecular docking approach with the MOE software to study the protein-ligand interactions between two target proteins, 3G5T and 7WJO and nineteen chemical compounds from essential oils. The docking results showed that the best S scores (after the S scores of the active molecules) were for Palmitic acid (CID-985) with 3G5T (S score -8.0938) and with the protein 7WJO (S score -6.7963). Additionally, various aspects (hydrophobic interactions, electrostatic interactions, amino acid interactions) were studied in the binding site between the two target proteins and the best molecule, Palmitic acid, indicating in general hydrophobic (lipophilic) interactions Résumé : L'utilisation excessive de fongicides a causé de graves dommages à l'environnement et à la santé humaine. Pour atténuer ces problèmes, l'utilisation de biopesticides attire l'attention du monde entier, car il s'agit d'une stratégie plus sûre que les pesticides chimiques traditionnels. En effet, les risques qu'ils présentent pour l'homme et l'environnement sont moindres. Notre travail consiste à étudier l'activité antifongique des principaux composés de l'huile essentielle de Pistacia atlantica en utilisant une approche de docking moléculaire avec le logiciel MOE pour étudier les interactions protéine-ligand entre deux protéines cibles, 3G5T et 7WJO et dix-neuf composés chimiques provenant d'huiles essentielles. Les résultats de l'amarrage ont montré que les meilleurs scores S (après les scores S des molécules actives) étaient ceux de Palmitic acid (CID-985) avec la protéine 3G5T (score S -8,0938) et avec la protéine 7WJO (score S -6,7963). En outre, divers aspects (interactions hydrophobes, interactions électrostatiques, interactions entre acides aminés) ont été étudiés dans le site de liaison entre les deux protéines cibles (3G5T et 7WJO) et la meilleure molécule, Palmitic acid, en indiquant généralement des interactions hydrophobes (lipophiles) | |
| dc.identifier.other | 633-189-T | |
| dc.identifier.uri | http://dspace.univ-khenchela.dz:4000/handle/123456789/6587 | |
| dc.language.iso | en | |
| dc.publisher | Abbes Laghrour University,Khenchela | |
| dc.title | Evaluation of antifungal activity of Pistacia atlantica by molecular docking approach | |
| dc.type | Thesis |