Exploitation de logiciel TREECON for Windows pour l’élaboration des arbres phylogénétiques à partir de l’électrophorèse des marqueurs moléculaires
No Thumbnail Available
Date
2024
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
UNIVERSITE ABBES LAGHROUR KHENCHELA
Abstract
Abstract
Molecular phylogenetics is a crucial field for understanding the evolutionary relationships
between organisms using nucleotide or amino acid sequences. Software like TREECN on
Windows facilitates these analyses. This approach is not limited to studying relationships
between species but also allows for exploring genome evolution. By examining multigene
families, researchers can assess the importance of duplication events and horizontal gene
transfers.
The reliability of phylogenetic reconstruction methods relies on a deep understanding of
the evolutionary mechanisms of sequences. Recent advances in this field have refined the
representation of the universal tree of life. Additionally, these advances benefit the study of
protein functional constraints, especially in identifying positions subject to Darwinian
selection. This knowledge is essential for predicting potential functional changes and
guiding experimental studies.
Résumé
La phylogénie moléculaire vise à reconstruire les relations de parenté entre des
séquences de nucléotides ou d’acides aminés en utilisant des logiciels comme TREECN
sous Windows. Cette méthode permet d’étudier non seulement les relations entre les
espèces, mais aussi l’évolution des génomes. En analysant les familles multi-géniques, on
peut évaluer l’importance relative des événements de duplication et des transferts
horizontaux de gènes. La fiabilité des méthodes de reconstruction phylogénétique repose
sur une compréhension approfondie des mécanismes évolutifs des séquences , un domaine
qui a connu des avancées significatives ces dernières années.
Ces progrès ont conduit à une vision plus précise de l’arbre universel du vivant. L’étude
des contraintes fonctionnelles des protéines bénéficie également de ces avancées, en
particulier pour la détection des positions dans une protéine soumises à une section
darwinienne. Cela permet de prédire les changements fonctionnels possibles et de guider
les études expérimentales en conséquence.
ملخص علم التطور الجزيئي هو مجال أساسي لفهم العلاقات التطورية بين الكائنات الحية باستخدام تسلسلات النيوكليوتيدات أو الأحماض الأمينية. استخدام برامج مثل TREECN على نظام التشغيل وينداوز يسهل هذه التحليلات لا تقتصر هذه الطريقة على دراسة العلاقات بين الأنواع فقط، بل تتيح أيضا استكشاف تطور الجينومات من خلال فحص العائلات متعددة الجينات، يمكن للباحثين تقييم أهمية أحداث التضاعف والنقل الأفقي للجينات تعتمد موثوقية طرق إعادة بناء شجرة التطور على فهم عميق لآليات تطور التسلسلات أدت التقدمات الأخيرة في هذا المجال إلى تحسين تمثيل شجرة الحياة العالمية. بالإضافة إلى ذلك، تستفيد دراسة القيود الوظيفية للبروتينات من هذه التقدمات، خصوصا في تحديد المواقع الخاضعة للانتقاء الدارويني هذه المعرفة أساسية للتنبؤ بالتغيرات الوظيفية المحتملة وتوجيه الدراسات
التجريبية.