Molecular Modeling Of The Interaction Protein-Ligand Using Molecular Docking: Natural Products Megx Database Screening-Pbpa1.
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Date
2017
Authors
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Publisher
Abbes Laghrour University, Khenchela
Abstract
L'objectif principal de cette étude était de découvrir, grâce au criblage virtuel, de nouveaux
inhibiteurs de Penicillin Binding Protein a1 (PBPa1), à partir de la base de données MEGx,
cette protéine est la cible naturelle des ß-lactamines est responsables de la résistance actuelle
accrue. L’amarrage moléculaire a été réalisé en utilisant PyRx et Autodock Vina, pour étudier
les interactions de liaison de 500 composés avec les cibles, seulement 4 molécules ont donné
de bons résultats NP-000205, NP-000206, NP-000122, NP-000251: -11,2 Kcal / mol, -11,2
Kcal / mol, -11,2 Kcal / mol , -11,2 Kcal / mol respectivement, par rapport à l'inhibiteur
original MES -5,6Kcal / mol. La pharmacocinétique de ces molécules a été testée,
l'application de la règle de cinq de Lipinski a donné des informations positives sur les
propriétés pharmacocinétiques de NP-000122, NP-000251 qui sont des inhibiteurs de la PBP
a1.Les propriétés de perméabilité pour NP-000205, NP-000206 ont été trouvées dans la limite
indiquée pour la règle de cinq de Lipinski. Le programme d'approche de
l’amarragemoléculaire avec Autodock est considéré parmi les meilleures techniques utilisées
aujourd'hui pour développer des protéines plus efficaces.