Molecular Modeling Of The Interaction Protein-Ligand Using Molecular Docking: Natural Products Megx Database Screening-Pbpa1.

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Date
2017
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Publisher
Abbes Laghrour University, Khenchela
Abstract
L'objectif principal de cette étude était de découvrir, grâce au criblage virtuel, de nouveaux inhibiteurs de Penicillin Binding Protein a1 (PBPa1), à partir de la base de données MEGx, cette protéine est la cible naturelle des ß-lactamines est responsables de la résistance actuelle accrue. L’amarrage moléculaire a été réalisé en utilisant PyRx et Autodock Vina, pour étudier les interactions de liaison de 500 composés avec les cibles, seulement 4 molécules ont donné de bons résultats NP-000205, NP-000206, NP-000122, NP-000251: -11,2 Kcal / mol, -11,2 Kcal / mol, -11,2 Kcal / mol , -11,2 Kcal / mol respectivement, par rapport à l'inhibiteur original MES -5,6Kcal / mol. La pharmacocinétique de ces molécules a été testée, l'application de la règle de cinq de Lipinski a donné des informations positives sur les propriétés pharmacocinétiques de NP-000122, NP-000251 qui sont des inhibiteurs de la PBP a1.Les propriétés de perméabilité pour NP-000205, NP-000206 ont été trouvées dans la limite indiquée pour la règle de cinq de Lipinski. Le programme d'approche de l’amarragemoléculaire avec Autodock est considéré parmi les meilleures techniques utilisées aujourd'hui pour développer des protéines plus efficaces.
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