Approches Métagénomiques En Microbiologie Du Sol
No Thumbnail Available
Date
2022
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Université Abbes Laghrour -Khenchela-
Abstract
Abstract
Over the past decade, metagenomics has made great strides in measuring
microbial ecology, in particular the diversity and evolution of microorganisms in the
soil. That is why This study was carried out to list the different techniques used for the
analysis of microbial biodiversity in the soil. Indeed, there are many cultivable and noncultivable microorganisms at the soil level, which makes their classification a little
complicated. The researchers used metagenomics to study microbes that cannot be
cultured.
Several methods of independent culture (Metagenomics) have been well studied
by the literature and each has its own applications, namely DGGE, ARISA, RIZA,
SSCP, T.RFLP, DHPLC and pyrosequance454.
The theoretical data obtained and the tools developed in this study can be used to
directly apply the methagenomic approach in the laboratory by an experimental study
on a terrestrial ecosystem - the semi-arid soil of the khenchela region.
ملخص
على مدى العقد الماضي ، خطت الميتاجينوميات خطوات كبيرة في قياس البيئة الميكروبية ، ولا سيما تنوع وتطور الكائنات الحية الدقيقة في التربة. هذا هو السبب في إجراء هذه الدراسة لسرد التقنيات المختلفة المستخدمة لتحليل التنوع البيولوجي الميكروبي في التربة. في الواقع ، هناك العديد من الكائنات الحية الدقيقة القابلة للزراعة وغير القابلة للزراعة على مستوى التربة ، مما يجعل تصنيفها معقدا بعض الشيء. استخدم الباحثون الميتاجينوميات لدراسة الميكروبات التي لا يمكن تربيتها.
وقد تم دراسة العديد من أساليب الثقافة المستقلة ميتاجينوميكس جيدا من قبل الأدب ولكل منها تطبيقاتها الخاصة ، وهي شبه القاحلة تغيير طبيعة التدرج الكهربائي للهلام ، تحليل فاصل الريبوسوم البيني الآلي ، تعدد أشكال الحمض النووي الواحد المتشكلة ، تعدد شكل طول جزء الحصر ، الفصل الكروماتوغرافي السائل بالضغط العالي في حالة الفصل ، التسلسل الحراري 454.
يمكن استخدام البيانات النظرية التي تم الحصول عليها والأدوات التي تم تطويرها في هذه الدراسة لتطبيق نهج الميثاجينوميك بشكل مباشر في المختبر من خلال دراسة تجريبية على نظام بيئي أرضي - التربة شبه القاحلة
في منطقة خنشلة.