Optimisation de l'extraction des flavonoïdes à activité anti-oxydante des galles de Pistacia lentiscus.
No Thumbnail Available
Date
2020
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Université Abbes Laghrour -Khenchela-
Abstract
Résumé
La recherche en biologie ne peut, actuellement, se passer des outils informatiques pour
traiter les données produites et optimiser ses avancées. L’un de ces outils est la modélisation
moléculaire et plus précisément l’arrimage moléculaire (plus souvent connu sous le terme
"docking"). L’emploi initial du "docking" moléculaire a été de prédire et reproduire des
complexes (protéine-ligand). Le docking est la base de la reconnaissance moléculaire et du
type d’interaction. À chaque protéine cible de structure connue le docking se révèle être la clé
dans le design de nouveaux ligands.
Notre travail consiste à étudier l’activité anti-oxydante des composés de l’huile
essentielle des galles de Pistacia lentiscus par l’approche bioinformatique pour l’étude
d’interaction protéines-ligands in silico de quatre protéines (Glycolate oxydase, Sarcosine
oxydase, Tyrosine kinase et Peroxiredoxin 5).
Nos résultats montrent que le (2-Undecanone) a un effet anti-oxydant important par
rapport aux autres composés de l’huile essentielle de Pistacia lentiscus du au meilleur score
qu’il présente avec les différents protéines.
Abstract
Research in biology cannot currently do without computer tools to process the data
produced and optimize its advances. One of these tools is molecular modeling and more
specifically molecular stowage (more commonly known as "docking"). The initial use of
molecular "docking" was to predict and reproduce protein-ligand complexes. Docking is the
basis for molecular recognition and the type of interaction. With each target protein of known
structure the docking proves to be the key in the design of new ligands.
Our work consists in studying the antioxidant activity of the hexes of Pistacia lentiscus
galls were studied in vitro and by the bioinformatic approach for the study of protein-ligand
interaction in silico of four proteins (Glycolate oxidase, Sarcosine oxidase, Tyrosine kinase
and Peroxiredoxin 5).
Our results show that (2-Undecanone) has an important anti-oxidant effect compared to
the other EO compounds of Pistacia lentiscus due to the better score it presents with the
different proteins.
ملخص
فیما یخص الأبحاث البیولوجیة لا یمكن القیام بھا حالیا بدون استعمالأدوات الكمبیوتر لمعالجة النتائج المحصلة
علیھا وبالتالي تحسین ھذھالأخیرة .بواسطة تقنیات النموذجیة الجزیئیة وبالتدقیق الالتحام الجزیئیعلیھا
معروفبالمصطلح"الالتحام".الاستعمال الأولي للالتحام الجزیئي ھوالاعتراف و الاستنساخ المركبات بروتین -
مثبطات.الالتحامھو أساس الاعترافالجزیئي ونوع من التفاعل لكل بروتین الھدف من ھیكل معروف التحام یبرھنعلى أن
تكون المفتاح في تصمیم مادة تفاعل جدیدة.
بحثنا یحتوي على دراسة نشاط مضادات الأكسدة للزیوت الأساسیة لأورام نباتالضرو التي تمت دراستھا في
المختبر ومن جھةأخرى أجریت دراسة تفاعلبروتینات - مثبطات من خلال النھج المعلوماتي الحیوي لأربعة بروتینات
( وظیفیة ( أوكسیدیز غلیكولات ، أوكسیدیز ساركوزین ، تیروسین كیناز وبیروكسیریدوكسین 5
2- ) لھا تاثیر مضاد للأكسدة قوي مقارنة بالمركبات الأخرى Undecanone ) تظھر نتائجنا أن مادة التفاعل
لزیوت الاساسیة(العطریة)لأورام نباتالضرو نظرا لدرجة الافضل من التكامل البنیوي التي یبرزھا مع البروتینات الوظیفیة