Browsing by Author "Sakhria Dhikra"

Now showing 1 - 1 of 1
  • No Thumbnail Available
    Item
    Exploitation de logiciel TREECON for Windows pour l’élaboration des arbres phylogénétiques à partir de l’électrophorèse des marqueurs moléculaires
    (UNIVERSITE ABBES LAGHROUR KHENCHELA, 2024) Sakhria Dhikra; Encadrant :Dr Khabthaneabdel Hamid; Présidente : Dr Aouidane Laiche; Examinatrice : Dr Abaidia Abdelghfour
    Abstract Molecular phylogenetics is a crucial field for understanding the evolutionary relationships between organisms using nucleotide or amino acid sequences. Software like TREECN on Windows facilitates these analyses. This approach is not limited to studying relationships between species but also allows for exploring genome evolution. By examining multigene families, researchers can assess the importance of duplication events and horizontal gene transfers. The reliability of phylogenetic reconstruction methods relies on a deep understanding of the evolutionary mechanisms of sequences. Recent advances in this field have refined the representation of the universal tree of life. Additionally, these advances benefit the study of protein functional constraints, especially in identifying positions subject to Darwinian selection. This knowledge is essential for predicting potential functional changes and guiding experimental studies. Résumé La phylogénie moléculaire vise à reconstruire les relations de parenté entre des séquences de nucléotides ou d’acides aminés en utilisant des logiciels comme TREECN sous Windows. Cette méthode permet d’étudier non seulement les relations entre les espèces, mais aussi l’évolution des génomes. En analysant les familles multi-géniques, on peut évaluer l’importance relative des événements de duplication et des transferts horizontaux de gènes. La fiabilité des méthodes de reconstruction phylogénétique repose sur une compréhension approfondie des mécanismes évolutifs des séquences , un domaine qui a connu des avancées significatives ces dernières années. Ces progrès ont conduit à une vision plus précise de l’arbre universel du vivant. L’étude des contraintes fonctionnelles des protéines bénéficie également de ces avancées, en particulier pour la détection des positions dans une protéine soumises à une section darwinienne. Cela permet de prédire les changements fonctionnels possibles et de guider les études expérimentales en conséquence. ملخص علم التطور الجزيئي هو مجال أساسي لفهم العلاقات التطورية بين الكائنات الحية باستخدام تسلسلات النيوكليوتيدات أو الأحماض الأمينية. استخدام برامج مثل TREECN على نظام التشغيل وينداوز يسهل هذه التحليلات لا تقتصر هذه الطريقة على دراسة العلاقات بين الأنواع فقط، بل تتيح أيضا استكشاف تطور الجينومات من خلال فحص العائلات متعددة الجينات، يمكن للباحثين تقييم أهمية أحداث التضاعف والنقل الأفقي للجينات تعتمد موثوقية طرق إعادة بناء شجرة التطور على فهم عميق لآليات تطور التسلسلات أدت التقدمات الأخيرة في هذا المجال إلى تحسين تمثيل شجرة الحياة العالمية. بالإضافة إلى ذلك، تستفيد دراسة القيود الوظيفية للبروتينات من هذه التقدمات، خصوصا في تحديد المواقع الخاضعة للانتقاء الدارويني هذه المعرفة أساسية للتنبؤ بالتغيرات الوظيفية المحتملة وتوجيه الدراسات التجريبية.